L'inventaire est l'opération qui consiste à compter physiquement les articles détenus en stock, puis à les valoriser pour en déterminer la valeur comptable. Il permet de comparer le stock théorique (celui enregistré dans le système) au stock réel présent dans l'entrepôt, et de constater d'éventuels écarts d'inventaire (vols, casse, erreurs de saisie, démarque).
En France, l'inventaire annuel est une obligation légale : l'article L.123-12 du Code de commerce impose de contrôler au moins une fois tous les douze mois l'existence et la valeur des éléments d'actif. Plusieurs méthodes coexistent : l'inventaire intermittent (un grand comptage en fin d'exercice), l'inventaire permanent (mise à jour continue à chaque mouvement) et l'inventaire tournant (comptage par roulement de sous-ensembles d'articles tout au long de l'année).
La valorisation s'appuie sur des conventions normées, le plus souvent le coût unitaire moyen pondéré (CUMP) ou le premier entré, premier sorti (FIFO). Pour prioriser les comptages, beaucoup d'organisations s'appuient sur la méthode ABC, qui concentre l'effort sur les références à plus forte valeur, et sur des règles de rotation comme le FEFO pour les produits à date de péremption.
Le module Stock d'eyeot tient les mouvements et les niveaux de stock, ce qui sert de base au rapprochement lors des campagnes d'inventaire.